Ferns at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK)

Versão mais recente publicado por Central Siberian Botanical Garden SB RAS em Aug 11, 2021 Central Siberian Botanical Garden SB RAS

Herbarium specimens of ferns kept at the Central Siberian Botanical Garden SB RAS (NS, NSK) were digitised in 2021. Specimens of 20 families of Polypodiopsida were included in this dataset except Equisetaceae. Family Ophioglossaceae was digitised and published separately (Kovtonyuk et al., 2021). Specimens published in datasets "Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium" (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2020, 2021) and "Foreign Asia herbarium collection in CSBG (NS)" (Gatilova et al., 2020) were also excluded.

In the dataset specimens from 43 countries of Europe, Asia, America, Africa and Australia (Oceania) are presented, most of them are from Russia (6918). 5092 specimens from Russia are published in the first time.

Collectors with most gathered specimens are: Krasnoborov I. M. (913), Ivanova M. M. (565), Shaulo D. N. (538), Malyshev L. I. (296), Kiseleva A. A. (281), Lashchinsky N. N. (270), Hanminchun V. M. (251), Vodopyanova N. S. (230), Bardunov L. V. (196), Peshkova G. A. (147), Lomonosova M. N. (133), Petrochenko Yu. N. (126), Andrulaitis S. Yu. (126), Artemov I. A. (116), Arslanova N. K. (Kovtonyuk N. K.) (104), Molchanov E. F. (93), Bolshakov N. M. (88), Chepurnov A. A. (85), Maskaev Yu. M. (81), Vlasova N. V. (76), Ronginskaya A.V. (73), Vereshchagin V. I. (73), Doronkin V. M. (71), Friesen N. V. (67), Popov M. G. (62), Zuev V. V. (61), Titov E. (49), Starovoitova Z. (49), Pospelov I. N. (44), Tyulina L. N. (42), Nechaev A. A. (42).

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 7,758 registros. Também existem 1 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

  • Occurrence (core)
    7758
  • Multimedia 
    7758

Este IPT armazena os dados e, portanto, serve como um repositório de dados. Os dados e os metadados do recurso estão disponíveis para download no seção de downloads. A tabela de versões lista outras versões do recurso que foram disponibilizadas ao público e permite o rastreamento das alterações realizadas no recurso ao longo do tempo.

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Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E, Ovchinnikov Y, Ovchinnikova S, Troshkina V, Lukmanova L, Ebel A, Yakubov V, Lashchinskiy N, Gureyeva I, Artemov I, Zibzeev E (2021): Ferns at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK). v1.4. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Dataset/Occurrence. http://www.csbg.nsc.ru:8080/ipt/resource?r=ferns&v=1.4

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Central Siberian Botanical Garden SB RAS. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 77973bd8-e146-463e-9452-05debd36c12a.  Central Siberian Botanical Garden SB RAS publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Participant Node Managers Committee.

Palavras-chave

Occurrence; Specimen

Contatos

Quem criou esse recurso:

Nataliya Kovtonyuk
Senior researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU +79529365495
Irina Han
Main engineer
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Evgeniya Gatilova
Main specialists
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Yuri Ovchinnikov
Main specialist
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Svetlana Ovchinnikova
Leading researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Viktoria Troshkina
Head of laboratory
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Lyalya Lukmanova
Senior laboratory assistant
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Alexander Ebel
Leading researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Valentin Yakubov
Senior Researcher
Federal Scientific Center of the East Asia Terrestrial Biodiversity FEB RAS Prospekt 100‑let Vladivostoka, 159 690022 Vladivostok Primorsky Krai
Nikolay Lashchinskiy
Сhief researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl.
https://csbg-nsk.ru/lashchinskiy_nn
Irina Gureyeva
Head of Herbarium
Tomsk State University 36, Lenin Avenue 634050 Tomsk Tomskaya obl. RU
https://persona.tsu.ru/Home/UserProfile/95
Igor Artemov
Senior researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Evgeniy Zibzeev
Head of laboratory
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl.
https://csbg-nsk.ru/zibzeev_eg

Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:

Nataliya Kovtonyuk
Senior Researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU +79529365495
Irina Han
main engineer
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU

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Nataliya Kovtonyuk
Senior researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
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Main engineer
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl.

Quem mais foi associado com o recurso:

Autor
Nataliya Kovtonyuk
Senior Researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU +79529365495

Cobertura Geográfica

Specimens from 43 countries presented: Russia (6918), United States of America (270), Germany (145), Canada (60), Georgia (40), Japan (31), Kazakhstan (29), Mongolia (27), Ukraine (25), Paraguay (20), Finland (20), Costa Rica (13), Turkey (12), Switzerland (12), Poland (12), Azerbaijan (12), Hungary (9), Bulgaria (9), Armenia (9), Norway (8), Kyrgyzstan (6), Italy (6), France (6), Moldova (5), Estonia (5), Czechia (5), Belize (5), Sweden (4), Mexico (4), Tajikistan (3), Slovakia (3), Romania (3), Luxembourg (3), Dominican Republic (3), Belarus (3), Uzbekistan (1), Turkmenistan (1), Seychelles (1), New Zealand (1), New Caledonia (1), Greenland (1), China (1), Austria (1). 52 regions of Russia are presented. Among them are all regions of Siberia, Russian Far East, Ural, but most of the specimens from European Russian regions were already published in the dataset "Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium" (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2020). Most specimens were collected from Republic of Buryatia (1032), Krasnoyarsk Krai (935), Irkutsk Oblast (823), Tuva Republic (773), Altai Republic (572), Novosibirsk Oblast (456), Primorsky Krai (382), Republic of Khakassia (351), Sakha (Yakutia) Republic (275), Zabaykalsky Krai (252).

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-36.86, -173.02], Norte Leste [75.367, -166.567]

Cobertura Taxonômica

Specimens of 20 families of ferns were included in this dataset: Anemiaceae (2), Aspleniaceae (391), Athyriaceae (1132), Blechnaceae (21), Cyatheaceae (9), Cystopteridaceae (1816), Dennstaedtiaceae (232), Dryopteridaceae (1594), Hymenophyllaceae (8), Lygodiaceae (2), Marsileaceae (4), Onocleaceae (232), Osmundaceae (39), Plagiogyriaceae (1), Polypodiaceae (439), Psilotaceae (1), Pteridaceae (425), Salviniaceae (58), Thelypteridaceae (284), Woodsiaceae (1068). The Ophioglossaceae family was previously published in dataset “Ophioglossaceae at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK)”. The Equisetaceae family was excluded from this dataset. Most specimens are from the genera Dryopteris (1280), Cystopteris (1098), Woodsia (1067), Athyrium (803), Gymnocarpium (709), Polypodium (416), Asplenium (340), Diplazium (325), Polystichum (233), Pteridium (205), Cryptogramma (201), Phegopteris (158), Matteuccia (154), Cheilanthes (120), Thelypteris (85), Aspidium (68), Salvinia (56), Adiantum (55), Struthiopteris (46), Camptosorus (41).

Família  Anemiaceae,  Aspleniaceae,  Athyriaceae,  Blechnaceae,  Cyatheaceae,  Cystopteridaceae,  Dennstaedtiaceae,  Dryopteridaceae,  Hymenophyllaceae,  Lygodiaceae,  Marsileaceae,  Onocleaceae,  Osmundaceae,  Plagiogyriaceae,  Polypodiaceae,  Psilotaceae,  Pteridaceae,  Salviniaceae,  Thelypteridaceae,  Woodsiaceae
Gênero  Acrostichum,  Adiantopsis,  Adiantum,  Aleuritopteris,  Ananthacorus,  Anchistea,  Anemia,  Arachniodes,  Argyrochosma,  Aspidium,  Asplenium,  Athyrium,  Azolla,  Blechnum,  Bolbitis,  Camptosorus,  Campyloneurum,  Ceterach,  Cheilanthes,  Coniogramme,  Crypsinus,  Cryptogramma,  Ctenitis,  Cyathea,  Cyclophorus,  Cyrtomium,  Cystopteris,  Dennstaedtia,  Deparia,  Diplazium,  Dryopteris,  Gymnocarpium,  Hymenophyllum,  Hypolepis,  Lepisorus,  Leptorumohra,  Loxogramme,  Lygodium,  Marsilea,  Matteuccia,  Mecodium,  Microlepia,  Monachosorum,  Neocheiropteris,  Nephrodium,  Notholaena,  Onoclea,  Oreopteris,  Osmunda,  Osmundastrum,  Parablechnum,  Parathelypteris,  Pellaea,  Phanerophlebia,  Phegopteris,  Phyllitis,  Pilularia,  Plagiogyria,  Pleopeltis,  Pleurosoriopsis,  Polypodium,  Polystichum,  Protowoodsia,  Pseudocystopteris,  Psilotum,  Pteridium,  Pteris,  Pyrrosia,  Rhizomatopteris,  Salvinia,  Scolopendrium,  Sphaerocionium,  Stegnogramma,  Struthiopteris,  Thelypteris,  Trichomanes,  Woodsia,  Woodwardia

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 1851-05-01 / 2021-05-17

Dados Sobre o Projeto

Nenhuma descrição disponível

Título Russia 2021
Identificador N-Eurasia-Russia2021

O pessoal envolvido no projeto:

Autor
Nataliya Kovtonyuk
Programador
Irina Han
Processador
Evgeniya Gatilova
Curador
Lyalya Lukmanova

Métodos de Amostragem

Dried and pressed herbarium specimens were digitized using two special scanners, ObjectScan 1600, according to the international standards, at 600 dpi, with a barcode, 24-color scale and spatial scale bar (Kovtonyuk, 2017; Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2018). Images (*.jpg files) and metadata are stored in the CSBG SB RAS Digital Herbarium generated by ScanWizard Botany and MiVapp Botany software (Microtek, Taiwan).

Área de Estudo All ferns stored in NS and NSK herbarium collections were digitized by staff of the Digitization group in the Vascular Plant Systematics Laboratory of CSBG SB RAS.
Controle de Qualidade Specialists from the Tomsk State Univercity, Altay State Univercity (Barnaul), Irkutsk State University, Taymyr Nature Reserve, Main botanical Garden (Moskow), and the CSBG SB RAS took part in the identification of herbarium specimens.

Descrição dos passos do método:

  1. The digitization process includes the following 6 steps (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2018): 1. Mounting of dry plant material onto a herbarium sheet; 2. Checking the identification and nomenclature by a specialist; 3. Barcoding the specimen: printing a barcode on the thermal printer and affixing it to the herbarium sheet; 4. Placing the herbarium sheet, 24-color scale and scale bar on the scanner platform and image capturing; 5. Generating metadata, labeling OCR by ScanWizard Botany and verification of the label text by experts; 6. Archive management by MiVapp-Botany.

Dados de Coleção

Nome da Coleção I.M.Krasnoborov Herbarium at the Central Siberian Botanical garden SB RAS
Identificador da Coleção NS
Nome da Coleção M.G. Popov Herbarium at the Central Siberian Botanical garden SB RAS
Identificador da Coleção NSK
Métodos de preservação do espécime Seco e prensado

Citações bibliográficas

  1. Kovtonyuk N., Han I., Gatilova E. (2019). Digital Herbarium Collections of the Central Siberian Botanical Garden SB RAS, Novosibirsk, Russia. In: Bychkov I., Voronin V. (eds). Information Technologies in the Research of Biodiversity. Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences. Springer, Cham. P.22–27. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-030-11720-7_4
  2. Kovtonyuk N.K., Han I.V., Gatilova E.A., Pshenichkina Yu.A. (2019). Digital Herbarium of the CSBG SB RAS in Global Biodiversity Information Facilities // Rast. Mir Asian. Russia. N 4 (36). P.68–73. DOI: 10.21782/RMAR1995-2449-2019-4(68-73).
  3. Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E (2020) Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital Herbarium. Biodiversity Data Journal 8: e56504. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e56504
  4. Kovtonyuk N., Han I. and Gatilova E. (2018). Digitization of the herbarium specimens of higher vascular plants in the Central Siberian Botanical Garden // Skvortsovia. V. 4, N 3. P.100-111. http://skvortsovia.uran.ru/2018/4302.pdf
  5. Kovtonyuk, N.K. (2017). Virtual herbarium collections as a resource for taxonomy and biodiversity study // Rast. Mir Asian. Russia. N 1(25). P. 98–104. DOI:10.21782/RMAR1995-2449-2017-1(98-104).
  6. Shmakov A.I. (2009). Key for the ferns of Russia. Barnaul: Artika, 126 p. ISBN 978-5-904016-12-8
  7. Shmakov A.I. (2011). Ferns of North Asia. Barnaul: Artika, 209 p. ISBN 978-5-905454-13-4
  8. Малышев Л.И., Доронькин В.М., Власова Н.В., Никифорова О.Д., Овчинникова С.В., Байков К.С., & Ковтонюк Н.К. (2012). Конспект флоры Азиатской России: Сосудистые растения/ Л.И. Малышев [и др.]; под ред. К.С. Байкова. Новосибирск: Издательство СО РАН. http://doi.org/10.5281/zenodo.4146886
  9. Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E, Grant J (2021). Ophioglossaceae at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK). Version 1.4. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/wabgnr
  10. Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E (2021). Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium. Version 1.9. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/7anvyu

Metadados Adicionais

Propósito The purpose of this publication is to share biodiversity data by using GBIF on example of the ferns stored at the Central Siberian Botanic Garden SB RAS in NS and NSK collections and provide open online access to the CSBG SB RAS Digital herbarium (http://herb.csbg.nsc.ru:8081) as a data worldwide resource for studying biodiversity.
Identificadores alternativos 77973bd8-e146-463e-9452-05debd36c12a
http://www.csbg.nsc.ru:8080/ipt/resource?r=ferns