Ferns at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK)
Última versión Publicado por Central Siberian Botanical Garden SB RAS en Aug 11, 2021
Herbarium specimens of ferns kept at the Central Siberian Botanical Garden SB RAS (NS, NSK) were digitised in 2021. Specimens of 20 families of Polypodiopsida were included in this dataset except Equisetaceae. Family Ophioglossaceae was digitised and published separately (Kovtonyuk et al., 2021). Specimens published in datasets "Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium" (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2020, 2021) and "Foreign Asia herbarium collection in CSBG (NS)" (Gatilova et al., 2020) were also excluded.
In the dataset specimens from 43 countries of Europe, Asia, America, Africa and Australia (Oceania) are presented, most of them are from Russia (6918). 5092 specimens from Russia are published in the first time.
Collectors with most gathered specimens are: Krasnoborov I. M. (913), Ivanova M. M. (565), Shaulo D. N. (538), Malyshev L. I. (296), Kiseleva A. A. (281), Lashchinsky N. N. (270), Hanminchun V. M. (251), Vodopyanova N. S. (230), Bardunov L. V. (196), Peshkova G. A. (147), Lomonosova M. N. (133), Petrochenko Yu. N. (126), Andrulaitis S. Yu. (126), Artemov I. A. (116), Arslanova N. K. (Kovtonyuk N. K.) (104), Molchanov E. F. (93), Bolshakov N. M. (88), Chepurnov A. A. (85), Maskaev Yu. M. (81), Vlasova N. V. (76), Ronginskaya A.V. (73), Vereshchagin V. I. (73), Doronkin V. M. (71), Friesen N. V. (67), Popov M. G. (62), Zuev V. V. (61), Titov E. (49), Starovoitova Z. (49), Pospelov I. N. (44), Tyulina L. N. (42), Nechaev A. A. (42).
Registros
Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 7,758 registros. también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.
- Occurrence (core)
- Multimedia
Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.
Descargas
Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:
Datos como un archivo DwC-A | descargar 7,758 registros en Inglés (672 KB) - Frecuencia de actualización: desconocido |
---|---|
Metadatos como un archivo EML | descargar en Inglés (45 KB) |
Metadatos como un archivo RTF | descargar en Inglés (22 KB) |
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:
Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E, Ovchinnikov Y, Ovchinnikova S, Troshkina V, Lukmanova L, Ebel A, Yakubov V, Lashchinskiy N, Gureyeva I, Artemov I, Zibzeev E (2021): Ferns at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK). v1.4. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Dataset/Occurrence. http://www.csbg.nsc.ru:8080/ipt/resource?r=ferns&v=1.4
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Central Siberian Botanical Garden SB RAS. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 77973bd8-e146-463e-9452-05debd36c12a. Central Siberian Botanical Garden SB RAS publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Participant Node Managers Committee.
Palabras Clave
Occurrence; Specimen
Contactos
¿Quién creó el recurso?:
¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:
¿Quién documentó los metadatos?:
¿Quién más está asociado con el recurso?:
Cobertura Geográfica
Specimens from 43 countries presented: Russia (6918), United States of America (270), Germany (145), Canada (60), Georgia (40), Japan (31), Kazakhstan (29), Mongolia (27), Ukraine (25), Paraguay (20), Finland (20), Costa Rica (13), Turkey (12), Switzerland (12), Poland (12), Azerbaijan (12), Hungary (9), Bulgaria (9), Armenia (9), Norway (8), Kyrgyzstan (6), Italy (6), France (6), Moldova (5), Estonia (5), Czechia (5), Belize (5), Sweden (4), Mexico (4), Tajikistan (3), Slovakia (3), Romania (3), Luxembourg (3), Dominican Republic (3), Belarus (3), Uzbekistan (1), Turkmenistan (1), Seychelles (1), New Zealand (1), New Caledonia (1), Greenland (1), China (1), Austria (1). 52 regions of Russia are presented. Among them are all regions of Siberia, Russian Far East, Ural, but most of the specimens from European Russian regions were already published in the dataset "Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium" (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2020). Most specimens were collected from Republic of Buryatia (1032), Krasnoyarsk Krai (935), Irkutsk Oblast (823), Tuva Republic (773), Altai Republic (572), Novosibirsk Oblast (456), Primorsky Krai (382), Republic of Khakassia (351), Sakha (Yakutia) Republic (275), Zabaykalsky Krai (252).
Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [-36.86, -173.02], Latitud Máxima Longitud Máxima [75.367, -166.567] |
---|
Cobertura Taxonómica
Specimens of 20 families of ferns were included in this dataset: Anemiaceae (2), Aspleniaceae (391), Athyriaceae (1132), Blechnaceae (21), Cyatheaceae (9), Cystopteridaceae (1816), Dennstaedtiaceae (232), Dryopteridaceae (1594), Hymenophyllaceae (8), Lygodiaceae (2), Marsileaceae (4), Onocleaceae (232), Osmundaceae (39), Plagiogyriaceae (1), Polypodiaceae (439), Psilotaceae (1), Pteridaceae (425), Salviniaceae (58), Thelypteridaceae (284), Woodsiaceae (1068). The Ophioglossaceae family was previously published in dataset “Ophioglossaceae at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK)”. The Equisetaceae family was excluded from this dataset. Most specimens are from the genera Dryopteris (1280), Cystopteris (1098), Woodsia (1067), Athyrium (803), Gymnocarpium (709), Polypodium (416), Asplenium (340), Diplazium (325), Polystichum (233), Pteridium (205), Cryptogramma (201), Phegopteris (158), Matteuccia (154), Cheilanthes (120), Thelypteris (85), Aspidium (68), Salvinia (56), Adiantum (55), Struthiopteris (46), Camptosorus (41).
Familia | Anemiaceae, Aspleniaceae, Athyriaceae, Blechnaceae, Cyatheaceae, Cystopteridaceae, Dennstaedtiaceae, Dryopteridaceae, Hymenophyllaceae, Lygodiaceae, Marsileaceae, Onocleaceae, Osmundaceae, Plagiogyriaceae, Polypodiaceae, Psilotaceae, Pteridaceae, Salviniaceae, Thelypteridaceae, Woodsiaceae |
---|---|
Género | Acrostichum, Adiantopsis, Adiantum, Aleuritopteris, Ananthacorus, Anchistea, Anemia, Arachniodes, Argyrochosma, Aspidium, Asplenium, Athyrium, Azolla, Blechnum, Bolbitis, Camptosorus, Campyloneurum, Ceterach, Cheilanthes, Coniogramme, Crypsinus, Cryptogramma, Ctenitis, Cyathea, Cyclophorus, Cyrtomium, Cystopteris, Dennstaedtia, Deparia, Diplazium, Dryopteris, Gymnocarpium, Hymenophyllum, Hypolepis, Lepisorus, Leptorumohra, Loxogramme, Lygodium, Marsilea, Matteuccia, Mecodium, Microlepia, Monachosorum, Neocheiropteris, Nephrodium, Notholaena, Onoclea, Oreopteris, Osmunda, Osmundastrum, Parablechnum, Parathelypteris, Pellaea, Phanerophlebia, Phegopteris, Phyllitis, Pilularia, Plagiogyria, Pleopeltis, Pleurosoriopsis, Polypodium, Polystichum, Protowoodsia, Pseudocystopteris, Psilotum, Pteridium, Pteris, Pyrrosia, Rhizomatopteris, Salvinia, Scolopendrium, Sphaerocionium, Stegnogramma, Struthiopteris, Thelypteris, Trichomanes, Woodsia, Woodwardia |
Cobertura Temporal
Fecha Inicial / Fecha Final | 1851-05-01 / 2021-05-17 |
---|
Datos del Proyecto
No hay descripción disponible
Título | Russia 2021 |
---|---|
Identificador | N-Eurasia-Russia2021 |
Personas asociadas al proyecto:
Métodos de Muestreo
Dried and pressed herbarium specimens were digitized using two special scanners, ObjectScan 1600, according to the international standards, at 600 dpi, with a barcode, 24-color scale and spatial scale bar (Kovtonyuk, 2017; Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2018). Images (*.jpg files) and metadata are stored in the CSBG SB RAS Digital Herbarium generated by ScanWizard Botany and MiVapp Botany software (Microtek, Taiwan).
Área de Estudio | All ferns stored in NS and NSK herbarium collections were digitized by staff of the Digitization group in the Vascular Plant Systematics Laboratory of CSBG SB RAS. |
---|---|
Control de Calidad | Specialists from the Tomsk State Univercity, Altay State Univercity (Barnaul), Irkutsk State University, Taymyr Nature Reserve, Main botanical Garden (Moskow), and the CSBG SB RAS took part in the identification of herbarium specimens. |
Descripción de la metodología paso a paso:
- The digitization process includes the following 6 steps (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2018): 1. Mounting of dry plant material onto a herbarium sheet; 2. Checking the identification and nomenclature by a specialist; 3. Barcoding the specimen: printing a barcode on the thermal printer and affixing it to the herbarium sheet; 4. Placing the herbarium sheet, 24-color scale and scale bar on the scanner platform and image capturing; 5. Generating metadata, labeling OCR by ScanWizard Botany and verification of the label text by experts; 6. Archive management by MiVapp-Botany.
Datos de la Colección
Nombre de la Colección | I.M.Krasnoborov Herbarium at the Central Siberian Botanical garden SB RAS |
---|---|
Identificador de la Colección | NS |
Nombre de la Colección | M.G. Popov Herbarium at the Central Siberian Botanical garden SB RAS |
---|---|
Identificador de la Colección | NSK |
Métodos de preservación de los ejemplares | Secado y prensado |
---|
Referencias Bibliográficas
- Kovtonyuk N., Han I., Gatilova E. (2019). Digital Herbarium Collections of the Central Siberian Botanical Garden SB RAS, Novosibirsk, Russia. In: Bychkov I., Voronin V. (eds). Information Technologies in the Research of Biodiversity. Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences. Springer, Cham. P.22–27. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-030-11720-7_4
- Kovtonyuk N.K., Han I.V., Gatilova E.A., Pshenichkina Yu.A. (2019). Digital Herbarium of the CSBG SB RAS in Global Biodiversity Information Facilities // Rast. Mir Asian. Russia. N 4 (36). P.68–73. DOI: 10.21782/RMAR1995-2449-2019-4(68-73).
- Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E (2020) Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital Herbarium. Biodiversity Data Journal 8: e56504. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e56504
- Kovtonyuk N., Han I. and Gatilova E. (2018). Digitization of the herbarium specimens of higher vascular plants in the Central Siberian Botanical Garden // Skvortsovia. V. 4, N 3. P.100-111. http://skvortsovia.uran.ru/2018/4302.pdf
- Kovtonyuk, N.K. (2017). Virtual herbarium collections as a resource for taxonomy and biodiversity study // Rast. Mir Asian. Russia. N 1(25). P. 98–104. DOI:10.21782/RMAR1995-2449-2017-1(98-104).
- Shmakov A.I. (2009). Key for the ferns of Russia. Barnaul: Artika, 126 p. ISBN 978-5-904016-12-8
- Shmakov A.I. (2011). Ferns of North Asia. Barnaul: Artika, 209 p. ISBN 978-5-905454-13-4
- Малышев Л.И., Доронькин В.М., Власова Н.В., Никифорова О.Д., Овчинникова С.В., Байков К.С., & Ковтонюк Н.К. (2012). Конспект флоры Азиатской России: Сосудистые растения/ Л.И. Малышев [и др.]; под ред. К.С. Байкова. Новосибирск: Издательство СО РАН. http://doi.org/10.5281/zenodo.4146886
- Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E, Grant J (2021). Ophioglossaceae at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK). Version 1.4. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/wabgnr
- Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E (2021). Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium. Version 1.9. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/7anvyu
Metadatos Adicionales
Propósito | The purpose of this publication is to share biodiversity data by using GBIF on example of the ferns stored at the Central Siberian Botanic Garden SB RAS in NS and NSK collections and provide open online access to the CSBG SB RAS Digital herbarium (http://herb.csbg.nsc.ru:8081) as a data worldwide resource for studying biodiversity. |
---|---|
Identificadores Alternativos | 77973bd8-e146-463e-9452-05debd36c12a |
http://www.csbg.nsc.ru:8080/ipt/resource?r=ferns |