Ferns at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK)

Última versión Publicado por Central Siberian Botanical Garden SB RAS en Aug 11, 2021 Central Siberian Botanical Garden SB RAS

Herbarium specimens of ferns kept at the Central Siberian Botanical Garden SB RAS (NS, NSK) were digitised in 2021. Specimens of 20 families of Polypodiopsida were included in this dataset except Equisetaceae. Family Ophioglossaceae was digitised and published separately (Kovtonyuk et al., 2021). Specimens published in datasets "Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium" (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2020, 2021) and "Foreign Asia herbarium collection in CSBG (NS)" (Gatilova et al., 2020) were also excluded.

In the dataset specimens from 43 countries of Europe, Asia, America, Africa and Australia (Oceania) are presented, most of them are from Russia (6918). 5092 specimens from Russia are published in the first time.

Collectors with most gathered specimens are: Krasnoborov I. M. (913), Ivanova M. M. (565), Shaulo D. N. (538), Malyshev L. I. (296), Kiseleva A. A. (281), Lashchinsky N. N. (270), Hanminchun V. M. (251), Vodopyanova N. S. (230), Bardunov L. V. (196), Peshkova G. A. (147), Lomonosova M. N. (133), Petrochenko Yu. N. (126), Andrulaitis S. Yu. (126), Artemov I. A. (116), Arslanova N. K. (Kovtonyuk N. K.) (104), Molchanov E. F. (93), Bolshakov N. M. (88), Chepurnov A. A. (85), Maskaev Yu. M. (81), Vlasova N. V. (76), Ronginskaya A.V. (73), Vereshchagin V. I. (73), Doronkin V. M. (71), Friesen N. V. (67), Popov M. G. (62), Zuev V. V. (61), Titov E. (49), Starovoitova Z. (49), Pospelov I. N. (44), Tyulina L. N. (42), Nechaev A. A. (42).

Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 7,758 registros. también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    7758
  • Multimedia 
    7758

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Versiones

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¿Cómo referenciar?

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Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E, Ovchinnikov Y, Ovchinnikova S, Troshkina V, Lukmanova L, Ebel A, Yakubov V, Lashchinskiy N, Gureyeva I, Artemov I, Zibzeev E (2021): Ferns at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK). v1.4. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Dataset/Occurrence. http://www.csbg.nsc.ru:8080/ipt/resource?r=ferns&v=1.4

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Central Siberian Botanical Garden SB RAS. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Registro GBIF

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Palabras Clave

Occurrence; Specimen

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Nataliya Kovtonyuk
Senior researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU +79529365495
Irina Han
Main engineer
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Evgeniya Gatilova
Main specialists
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Yuri Ovchinnikov
Main specialist
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Svetlana Ovchinnikova
Leading researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Viktoria Troshkina
Head of laboratory
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Lyalya Lukmanova
Senior laboratory assistant
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Alexander Ebel
Leading researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Valentin Yakubov
Senior Researcher
Federal Scientific Center of the East Asia Terrestrial Biodiversity FEB RAS Prospekt 100‑let Vladivostoka, 159 690022 Vladivostok Primorsky Krai
Nikolay Lashchinskiy
Сhief researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl.
https://csbg-nsk.ru/lashchinskiy_nn
Irina Gureyeva
Head of Herbarium
Tomsk State University 36, Lenin Avenue 634050 Tomsk Tomskaya obl. RU
https://persona.tsu.ru/Home/UserProfile/95
Igor Artemov
Senior researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Evgeniy Zibzeev
Head of laboratory
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl.
https://csbg-nsk.ru/zibzeev_eg

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Nataliya Kovtonyuk
Senior Researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU +79529365495
Irina Han
main engineer
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU

¿Quién documentó los metadatos?:

Nataliya Kovtonyuk
Senior researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU
Irina Han
Main engineer
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl.

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Autor
Nataliya Kovtonyuk
Senior Researcher
Central Siberian Botanical Garden SB RAS Zolotodolinskaya Str., 101 630090 Novosibirsk Novosibirskaya obl. RU +79529365495

Cobertura Geográfica

Specimens from 43 countries presented: Russia (6918), United States of America (270), Germany (145), Canada (60), Georgia (40), Japan (31), Kazakhstan (29), Mongolia (27), Ukraine (25), Paraguay (20), Finland (20), Costa Rica (13), Turkey (12), Switzerland (12), Poland (12), Azerbaijan (12), Hungary (9), Bulgaria (9), Armenia (9), Norway (8), Kyrgyzstan (6), Italy (6), France (6), Moldova (5), Estonia (5), Czechia (5), Belize (5), Sweden (4), Mexico (4), Tajikistan (3), Slovakia (3), Romania (3), Luxembourg (3), Dominican Republic (3), Belarus (3), Uzbekistan (1), Turkmenistan (1), Seychelles (1), New Zealand (1), New Caledonia (1), Greenland (1), China (1), Austria (1). 52 regions of Russia are presented. Among them are all regions of Siberia, Russian Far East, Ural, but most of the specimens from European Russian regions were already published in the dataset "Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium" (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2020). Most specimens were collected from Republic of Buryatia (1032), Krasnoyarsk Krai (935), Irkutsk Oblast (823), Tuva Republic (773), Altai Republic (572), Novosibirsk Oblast (456), Primorsky Krai (382), Republic of Khakassia (351), Sakha (Yakutia) Republic (275), Zabaykalsky Krai (252).

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-36.86, -173.02], Latitud Máxima Longitud Máxima [75.367, -166.567]

Cobertura Taxonómica

Specimens of 20 families of ferns were included in this dataset: Anemiaceae (2), Aspleniaceae (391), Athyriaceae (1132), Blechnaceae (21), Cyatheaceae (9), Cystopteridaceae (1816), Dennstaedtiaceae (232), Dryopteridaceae (1594), Hymenophyllaceae (8), Lygodiaceae (2), Marsileaceae (4), Onocleaceae (232), Osmundaceae (39), Plagiogyriaceae (1), Polypodiaceae (439), Psilotaceae (1), Pteridaceae (425), Salviniaceae (58), Thelypteridaceae (284), Woodsiaceae (1068). The Ophioglossaceae family was previously published in dataset “Ophioglossaceae at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK)”. The Equisetaceae family was excluded from this dataset. Most specimens are from the genera Dryopteris (1280), Cystopteris (1098), Woodsia (1067), Athyrium (803), Gymnocarpium (709), Polypodium (416), Asplenium (340), Diplazium (325), Polystichum (233), Pteridium (205), Cryptogramma (201), Phegopteris (158), Matteuccia (154), Cheilanthes (120), Thelypteris (85), Aspidium (68), Salvinia (56), Adiantum (55), Struthiopteris (46), Camptosorus (41).

Familia  Anemiaceae,  Aspleniaceae,  Athyriaceae,  Blechnaceae,  Cyatheaceae,  Cystopteridaceae,  Dennstaedtiaceae,  Dryopteridaceae,  Hymenophyllaceae,  Lygodiaceae,  Marsileaceae,  Onocleaceae,  Osmundaceae,  Plagiogyriaceae,  Polypodiaceae,  Psilotaceae,  Pteridaceae,  Salviniaceae,  Thelypteridaceae,  Woodsiaceae
Género  Acrostichum,  Adiantopsis,  Adiantum,  Aleuritopteris,  Ananthacorus,  Anchistea,  Anemia,  Arachniodes,  Argyrochosma,  Aspidium,  Asplenium,  Athyrium,  Azolla,  Blechnum,  Bolbitis,  Camptosorus,  Campyloneurum,  Ceterach,  Cheilanthes,  Coniogramme,  Crypsinus,  Cryptogramma,  Ctenitis,  Cyathea,  Cyclophorus,  Cyrtomium,  Cystopteris,  Dennstaedtia,  Deparia,  Diplazium,  Dryopteris,  Gymnocarpium,  Hymenophyllum,  Hypolepis,  Lepisorus,  Leptorumohra,  Loxogramme,  Lygodium,  Marsilea,  Matteuccia,  Mecodium,  Microlepia,  Monachosorum,  Neocheiropteris,  Nephrodium,  Notholaena,  Onoclea,  Oreopteris,  Osmunda,  Osmundastrum,  Parablechnum,  Parathelypteris,  Pellaea,  Phanerophlebia,  Phegopteris,  Phyllitis,  Pilularia,  Plagiogyria,  Pleopeltis,  Pleurosoriopsis,  Polypodium,  Polystichum,  Protowoodsia,  Pseudocystopteris,  Psilotum,  Pteridium,  Pteris,  Pyrrosia,  Rhizomatopteris,  Salvinia,  Scolopendrium,  Sphaerocionium,  Stegnogramma,  Struthiopteris,  Thelypteris,  Trichomanes,  Woodsia,  Woodwardia

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1851-05-01 / 2021-05-17

Datos del Proyecto

No hay descripción disponible

Título Russia 2021
Identificador N-Eurasia-Russia2021

Personas asociadas al proyecto:

Autor
Nataliya Kovtonyuk
Programador
Irina Han
Procesador
Evgeniya Gatilova
Curador
Lyalya Lukmanova

Métodos de Muestreo

Dried and pressed herbarium specimens were digitized using two special scanners, ObjectScan 1600, according to the international standards, at 600 dpi, with a barcode, 24-color scale and spatial scale bar (Kovtonyuk, 2017; Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2018). Images (*.jpg files) and metadata are stored in the CSBG SB RAS Digital Herbarium generated by ScanWizard Botany and MiVapp Botany software (Microtek, Taiwan).

Área de Estudio All ferns stored in NS and NSK herbarium collections were digitized by staff of the Digitization group in the Vascular Plant Systematics Laboratory of CSBG SB RAS.
Control de Calidad Specialists from the Tomsk State Univercity, Altay State Univercity (Barnaul), Irkutsk State University, Taymyr Nature Reserve, Main botanical Garden (Moskow), and the CSBG SB RAS took part in the identification of herbarium specimens.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. The digitization process includes the following 6 steps (Kovtonyuk, Han, Gatilova, 2018): 1. Mounting of dry plant material onto a herbarium sheet; 2. Checking the identification and nomenclature by a specialist; 3. Barcoding the specimen: printing a barcode on the thermal printer and affixing it to the herbarium sheet; 4. Placing the herbarium sheet, 24-color scale and scale bar on the scanner platform and image capturing; 5. Generating metadata, labeling OCR by ScanWizard Botany and verification of the label text by experts; 6. Archive management by MiVapp-Botany.

Datos de la Colección

Nombre de la Colección I.M.Krasnoborov Herbarium at the Central Siberian Botanical garden SB RAS
Identificador de la Colección NS
Nombre de la Colección M.G. Popov Herbarium at the Central Siberian Botanical garden SB RAS
Identificador de la Colección NSK
Métodos de preservación de los ejemplares Secado y prensado

Referencias Bibliográficas

  1. Kovtonyuk N., Han I., Gatilova E. (2019). Digital Herbarium Collections of the Central Siberian Botanical Garden SB RAS, Novosibirsk, Russia. In: Bychkov I., Voronin V. (eds). Information Technologies in the Research of Biodiversity. Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences. Springer, Cham. P.22–27. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-030-11720-7_4
  2. Kovtonyuk N.K., Han I.V., Gatilova E.A., Pshenichkina Yu.A. (2019). Digital Herbarium of the CSBG SB RAS in Global Biodiversity Information Facilities // Rast. Mir Asian. Russia. N 4 (36). P.68–73. DOI: 10.21782/RMAR1995-2449-2019-4(68-73).
  3. Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E (2020) Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital Herbarium. Biodiversity Data Journal 8: e56504. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e56504
  4. Kovtonyuk N., Han I. and Gatilova E. (2018). Digitization of the herbarium specimens of higher vascular plants in the Central Siberian Botanical Garden // Skvortsovia. V. 4, N 3. P.100-111. http://skvortsovia.uran.ru/2018/4302.pdf
  5. Kovtonyuk, N.K. (2017). Virtual herbarium collections as a resource for taxonomy and biodiversity study // Rast. Mir Asian. Russia. N 1(25). P. 98–104. DOI:10.21782/RMAR1995-2449-2017-1(98-104).
  6. Shmakov A.I. (2009). Key for the ferns of Russia. Barnaul: Artika, 126 p. ISBN 978-5-904016-12-8
  7. Shmakov A.I. (2011). Ferns of North Asia. Barnaul: Artika, 209 p. ISBN 978-5-905454-13-4
  8. Малышев Л.И., Доронькин В.М., Власова Н.В., Никифорова О.Д., Овчинникова С.В., Байков К.С., & Ковтонюк Н.К. (2012). Конспект флоры Азиатской России: Сосудистые растения/ Л.И. Малышев [и др.]; под ред. К.С. Байкова. Новосибирск: Издательство СО РАН. http://doi.org/10.5281/zenodo.4146886
  9. Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E, Grant J (2021). Ophioglossaceae at the Central Siberian Botanical Garden herbarium collections (NS, NSK). Version 1.4. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/wabgnr
  10. Kovtonyuk N, Han I, Gatilova E (2021). Vascular plants from European Russia in the CSBG SB RAS Digital herbarium. Version 1.9. Central Siberian Botanical Garden SB RAS. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/7anvyu

Metadatos Adicionales

Propósito The purpose of this publication is to share biodiversity data by using GBIF on example of the ferns stored at the Central Siberian Botanic Garden SB RAS in NS and NSK collections and provide open online access to the CSBG SB RAS Digital herbarium (http://herb.csbg.nsc.ru:8081) as a data worldwide resource for studying biodiversity.
Identificadores Alternativos 77973bd8-e146-463e-9452-05debd36c12a
http://www.csbg.nsc.ru:8080/ipt/resource?r=ferns